骨科专业是全军骨科中心、全军创伤骨科研究所所在单位，2006年批准成立成都军区昆明总医院附属骨科医院。设有显微外科动物实验室，骨密度检查室，资料室等基本配套设施，专用设备总值2000万元。2011年设立《临床骨科杂志》西南编辑部。科室展开床位446张，共12个病区。工作人员300人。行政系列：主任1人，副主任5人，护士长6人。主系列情况： 主系列40人，其中正高8人，副高9人。博士后6人，博士18人，硕士12人。硕士以上占92%，博士以上占56%。

科室近年来医疗工作数质量逐年攀升，发展势头良好。年门诊约9万人次，出院1万余人次，手术1万余台次，毛收入近3亿元，病人危重率约为15%。

特色专科技术有：四肢晚期战、创伤修复与功能重建，积累病例3200余例，效果良好。显微外科、手外科：各类复杂性断指再植5800例，成活率94%；手指再造300余例，成活率99%；吻合血管穿支皮瓣200余例，最细血管口径0.2mm；臂丛神经根性撕脱伤、周围神经损伤500余例，有效率80%。脊柱外科：手术治疗脊柱伤病4110例，优良率90%以上；人工椎间盘置换50例，优良率90%，难复性环枢椎脱位前路松解后路钉－板或钉棒系统固定，经皮球囊扩张椎体成形治疗骨质疏松性椎体压缩骨折等难度较大的手术。

近年来的创新技术包括：腕关节运动学及腕关节疾病临床治疗研究，如自主设计和研发了镍钛三角、四角融合器，用于部分腕骨融合术，具有融合快、术后勿需外固定的优点。数字化骨科的研究，如应用数字化技术，研发了三维重建软件及术前手术模拟系统、为复杂骨创伤手术制作导航模板，手术模拟实现椎弓根钉、髋关节置换、骶髂关节螺钉等精确手术。

科研方面：“十一五”以来在统计源期刊上发表论文600余篇，主编专著5部。5年内发表统计源期刊论文数≥8篇/人；SCI收录论文32篇。获国家二等奖1项；军队及省部级二等奖8项，近年获三等奖13项；获得专利20项。目前在研课题有20余项，其中国家自然科学基金3项，省部级重点课题5项。共计经费达800余万。科室承担了第三军医大学、第四军医大学、昆明医科大学、大理医学院、成都医学院等院校课堂教学及临床带教任务；还是第三军医大学、昆明医科大学博士培养点，成都军区昆明总医院及成都军区疾控中心博士后科研工作站。现有博士后联系导师3人，博导1人，硕导8人，培养毕业硕士研究生71人、博士研究生5人、博士后5人。每年培养军地进修医生100余人。

心血管专业是全军心血管内科专科中心、成都军区心血管内科研究所、国家卫计委冠心病介入诊疗培训基地、云南省医学会心血管病分会主任委员单位、第三军医大学和昆明医科大学博士、硕士生联合培养点、云南省冠心病综合防治省创新团队、云南省临床重点专科、国家优质护理示范病房。综合实力雄厚，技术优势明显。曾参加SHFIT、TRACK-D、CREATE等20余项大规模多中心临床研究，形成集心血管疾病预防、治疗、保健、科研和教学五位一体的特色医疗专科。目前开设五个病区共190张床位，其中冠心病监护病床（CCU）28张。现有仪器设备总价值4000余万元，包括西门子ATRIS数字平板心血管造影专用机、INNOVA2000数字平板心血管造影专用机、Datascope主动脉内球囊反搏泵（IABP）、Philips IE33超声心动图仪、Philips M3150B心电中央监护系统，可实时并回顾进行心电、血压、呼吸及指脉氧监测；PRUCKA 7000多导心电生理监测系统、Cordis射频消融仪，美国惠普5500型彩色多普勒超声心动图仪、Marquette 2000活动平板仪、24小时动态心电图、24小时血压监测仪等。每年完成心血管介入手术4000余例。近三年开展新技术、新业务8项，年门诊2.5万人次，年收治约6000人次，平均住院日8.81天，床位使用率99.04%。

全科现有医护人员129人，其中医生38名，拥有博士9名，硕士8名；正高级职称3名，副高级职称3名，发表SCI论著30余篇，国家统计源期刊200余篇，获云南省科技进步一等奖1项，科技进步二等奖2项、军队医疗成果二等奖1项，省和军队三等奖10项。承担国家自然科学基金、全军面上课题、军区重大课题、国家“十一五”攻关课题和973项目子课题、云南省自然科学基金课题和军区计划课题多项。

呼吸专业组是由临床医疗、教学、实验室及功能室组成的综合科室。目前科室展开床位60张，其中特优病房5间；呼吸重症监护病房床位10张。科室医务人员中有正高职称2名，副高职称5名，中级职称9名；其中博士2名，硕士5名。科室主任为主任医师、教授、目前担任云南省医学会呼吸学会主任委员，昆明医科大学和第三军医大学硕士研究生导师；中华医学会高原学会全国委员、中国呼吸医师协会全国常务委员，以及《中华呼吸和结核杂志》和《中华肺部疾病杂志》等杂志常务编委或编委。

科室拥有国内最先进的全套肺功能检测仪（含通气功能、支气管舒张试验、支气管激发试验、脉冲振荡肺阻抗检查、体描箱肺力学检查等）、电子支气管镜及西南地区唯一的荧光支气管镜，肺部成像检查仪、针型胸腔镜、BP840和西门子300型呼吸机等先进设备及先进的临床实验室。科室在省内率先开展莹光支气管镜检查诊断早期肺癌，气管、支气管内支架置入术，睡眠呼吸障碍性疾病诊治。专业特色：善长慢性支气管炎、肺气肿、肺心病、支气管哮喘的诊断与治疗。长期为肺气肿、肺心病患者提供医疗帮助和咨询，深受广大患者欢迎。近年来，在各专业学术杂志上发表学术论文100余篇，获省部级科技成果奖9项，在研课题4项，其中省科研基金课题和军区科研课题各1项。科室先后被评为先进科室、先进党支部、为兵服务先进单位、医保工作先进单位、安全工作先进单位、先进护理单元和护理安全先进单位。

目前科室开展的主要项目：①慢性支气管炎、肺气肿、肺心病急性发作期诊断、救治及康复期治疗；②支气管哮喘诊断与治疗，慢性哮喘病情控制及病情随访；③慢性咳嗽诊断与治疗；④肺部肿瘤早期诊断与治疗（全身及局部化疗、纤支镜下肿瘤内注射、氩气刀、微波治疗、气管支气管支架置入术治疗气道狭窄和肿瘤引起的肺不张、阻塞性肺炎）；⑤过敏性疾病过敏原测定及脱敏治疗；⑥睡眠呼吸暂停综合征诊断与治疗；⑦实验室开展项目：过敏原测定、结核菌素试验等；⑧微创胸腔镜检查诊断胸膜疾病；⑨肺部成像动态检查肺功能；⑩药物临床试验研究。

中医骨科专业所在附属中医院系全军综合医院中的第一所附属中医院，设中医内科、中医骨病痔瘘科、针灸理疗科、中药房4个科，展开床位90张，占全院床位总数的7%。实际工作人员70名，其中在编干部19名（高职7名、中职9名）。现为国家中医药管理局股骨头坏死重点专病中心，全军中医内科专科中心，军区股骨头坏死中医治疗研究所。两次被军区联勤部评为基层建设标兵单位和先进党支部，多次被医院评为先进党支部和先进科室，2005年被总后卫生部评为中医药工作先进单位，2007年被国家卫生部、国家中医药管理局、总后卫生部授予“全国综合医院中医药工作示范单位”称号。

主要业务范围是中西医结合治疗股骨头缺血性坏死、腰椎间盘突出等骨关节疾病及糖尿病等内科常见病、多发病及疑难病，在国内和军内均有较大的影响。长期以来，通过多种措施不断提高群体科研意识及科研能力，逐渐配备充实实验室。近年来，获得军队医疗成果二等奖2项，军地科技进步三等奖5项。发表文章120余篇。

肾病专业组是集医疗、教学、科研为一体的现代临床专科，下辖门诊、住院病区、肾病专科实验室、肾病专科小手术室、血液净化中心，有包括42套血液透析机和血液滤过机等价值1200余万元的医疗设备。科室是云南省最具规模的现代肾病临床专科。现有医务人员51名，其中博士2名，硕士4名，主任医师1名，副主任医师2名，主治医师5名，主管护师3名，护师20名，护士11名。共开展住院病床40张，月住院约120～130人次，月门诊约3000～3100人次，月血液净化治疗约2200～2400人次。科室主要收治各种原发性和继发性肾病综合症、慢性肾小球肾炎、间质性肾炎、泌尿系感染、糖尿病肾病、急性肾功能衰竭、慢性肾功能衰竭等各种肾脏疾病。同时还承担风湿免疫性疾病的诊治工作，主要收治系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、系统性血管炎和干燥综合症等风湿免疫性疾病。能独立进行肾脏病理学诊断和部分专科临床实验室检查和手术，如血液净化血流通路建立、各种操作和手术、腹膜透析置管手术。目前是云南省最大的血液净化中心，能进行血液透析、血液滤过、血浆置换、血液灌流、各种连续性肾脏替代治疗，在危重急性肾衰和多器官功能衰竭的抢救、药物和毒物中毒救治、各种原发性和继发性肾脏疾病以及自身免疫性疾病的诊治等均积累了丰富经验，维持性血液透析患者最长生存时间达20年。不论诊治病人数或病种数量均能满足药物临床试验要求。

消化专业是集医疗、教学、科研为一体的临床专科。始建于上世纪六十年代，经五十余年的艰苦奋斗现已发展为医疗技术全面、水平较高、教学经验丰富的综合性科室。目前展开床位40张，医务人员33人，其中主任医师2人、副主任医师2人、主治医师7人、主管护师1人、主管技师2人、医师2人。拥有博士2名、硕士3名。设有门诊、专科病房、消化内镜室、多弹头射频治疗室、结肠途径治疗室、胃肠功能检查室及消化实验室。医疗设备总价值1140万元。

神经内科专业是拥有高压氧治疗中心、神经电生理室、神经分子生物学诊断室、神经心理室、血流变学室、脑病生理治疗及生物反馈治疗室和神经中央监护系统的临床科室。其中高压氧为全国最大的氧舱，神经电生理检查是云南省司法鉴定中心指定检查点，脑病生理治疗及生物反馈治疗为云南省首创，生物反馈治疗是云南省培训中心，神经中央监护系统是云南省最先进的重症脑功能评价系统。医疗设备价值达3300余万元。

科室是昆明医科大学及第三军医大学硕士研究生培养点，博士后工作站联系导师培养点，长期承担了第三军医大学、第四军医大学、昆明医科大学、大理医学院等教学工作。目前科室的医疗特色包括脑内出血微创引流术、神经血管介入诊断及治疗、蛇毒酶干预性治疗预防脑血管病、脑外伤的神经康复治疗、神经生物物理治疗技术、小脑顶核慢性电刺激治疗技术、高压氧+NGF+GM1治疗神经系统难治性疾病和神经干细胞移植治疗神经变性病技术。

科室成员层荣获江泽民主席通令嘉奖，西藏军区和成都军区政治部通令表扬，中央军委表彰，成都军区联勤部表扬并荣立三等功，全院表彰；全军神经内科专委会授予终身成就奖。发表论文100余篇，获得军队及省科技进步奖二等奖1项，三等奖10项、四等奖6项。

戒毒专业于1999年通过国家卫生部现场核查，于2001年获得资格认定。自资格认定以来，受国家戒毒工作进行调整，绝大部分戒毒人员在公安强制戒毒所戒毒，且国内戒毒新药品种极少等方面影响，专业组截至2012年才开始承接药物临床试验项目。2006年专业组依托的我院全军药物依赖康复防治研究所撤销，人员院内分流，主要研究力量承托载体转至我院药学部，并逐渐成长一支专注于药物临床试验研究及管理的技术队伍。目前专业组共有16名研究人员，其中高职3人，中职7人。专业组研究人员均多次参加临床研究试验技术、统计分析、生物样本分析、临床研究质量管理和伦理等临床研究相关的各级（国际级、国家级、省部级和院内）培训，积累了丰富的理论和实践经验。专业组长和秘书还是云南省在国家食品药品监督管理总局药物临床试验现场核查专家数据库中唯一的两名现场核查专家。自2012年首次承接临床研究项目至今，团队作为主研完成了一类新药注射用替曲朵辛的IIa/IIb临床研究，以及三类化药复方盐酸丁丙诺啡舌下片的II/III期临床研究。近年来，团队发表论文80余篇，其中SCI文章20余篇；获国家、省部级以上课题8项；获省部级科技成果奖6项，专利7项。