医院始建于1952年，1994年获评全国首批示范中医院，2007年成为南京中医药大学江阴附属医院，2011年被江苏省中医管理局确定为三级乙等中医医院，2016年获评江苏省文明单位，2018年成立江阴市中医院医疗集团，连续多年在“艾力彼”全国县级中医医院排行榜中蝉联第二名。2023年成功创建三级甲等中医院，2024年6月新院区搬迁启用。医院现有开放床位1326张，近年来，年均门急诊量110万人次，年均住院总人数3.8万人，手术1万余台。医院设临床科室37个，医技科室10个，其中国家中医重点专科1个（皮肤科），江苏省中医重点专科6个（皮肤科、妇科、儿科、肺病科、脾胃病科、肛肠科），无锡市中医重点专科3个（神经外科、心血管科、内分泌科），江阴市重点专科7个（医疗美容科、口腔科、脑病科、肾病科、骨伤科、普通外科、眼科）。

医院现有职工1330人，医师505人，护理565人，药师87人，技师73人，其他人员99人，其中中级及以上人员665人。医院现有“江苏省名中医”2名、“无锡市名中医”3名、“江阴市名中医”23名，“无锡市双百人才4名”，江苏省“333”培养对象1名。

国医大师夏桂成工作室、国医大师禤国维工作室、全国名中医徐福松工作室、首批龙砂医学传承推广基地江阴工作站、石氏伤科石筱山临床研究分中心、澄江针灸学派传承工作站均落户医院。医院与东南大学附属中大医院合作建成影像、重症医学江阴分中心；胸外科引进上海市胸科医院罗清泉专家团队、骨科引进上海长征医院倪斌专家团队。

医院于2022年01月07日在药物临床试验机构备案管理信息平台完成备案（药临床机构备字2022000001）。2022年1月19日-20日通过江苏省药品监督管理局的备案后首次监督检查。已备案的专业有：呼吸内科、内分泌科、皮肤科、消化内科、骨科、妇科，可承担II、III、IV期药物临床试验。

机构设有机构主任、副主任，下设机构办公室，有机构办公室主任、副主任、机构秘书、质量管理员、药物管理员、生物样本管理员、档案管理员。机构配备有相应的办公设备设施、专用档案室、药物临床试验用药房，药物临床试验生物样本室，其设备实施基本齐备。