四川省第二中医医院药物/器械临床试验机构于2023年6月完成国家药监局备案网站备案，分别获得药物临床试验机构备案号：药临床机构备字 2023000089，医疗器械临床试验机构备案号：械临机构备202300075。2023年9月通过四川省药品监督管理局首次监督检查，成为有资质的药物和医疗器械临床试验机构。机构下设“5+3”（5个药物+3 个器械）专业，可承接对应的临床试验研究，其中药物组的5个专业分别为：妇科、老年病科、呼吸科、肿瘤科、皮肤科；器械组的3个专业分别为：针灸康复科、泌尿外科、乳腺科。医院高度重视临床研究工作，机构主任由医院院长担任，副主任由分管院领导担任。机构设置机构办公室、机构药库、资料室等。